MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL01

Total Repeats: 7409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011758	CCT	2	6	52	57	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218533257
2	NC_011758	CGA	2	6	60	65	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533257
3	NC_011758	CCT	2	6	67	72	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218533257
4	NC_011758	CGG	2	6	85	90	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533257
5	NC_011758	GATC	2	8	199	206	25 %	25 %	25 %	25 %	218533257
6	NC_011758	CCG	2	6	207	212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533257
7	NC_011758	CAA	2	6	214	219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218533257
8	NC_011758	CTC	2	6	221	226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218533257
9	NC_011758	ACG	2	6	248	253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533257
10	NC_011758	TTG	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218533257
11	NC_011758	CCA	2	6	378	383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218533257
12	NC_011758	CGC	2	6	417	422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533257
13	NC_011758	CTT	2	6	430	435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218533257
14	NC_011758	GCG	2	6	471	476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533257
15	NC_011758	TCT	2	6	558	563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218533257
16	NC_011758	GCC	2	6	573	578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533257
17	NC_011758	TCG	2	6	642	647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533257
18	NC_011758	CCG	2	6	761	766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533257
19	NC_011758	ACCA	2	8	803	810	50 %	0 %	0 %	50 %	218533257
20	NC_011758	CG	4	8	820	827	0 %	0 %	50 %	50 %	218533257
21	NC_011758	CGG	2	6	859	864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533257
22	NC_011758	CGA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533257
23	NC_011758	GC	3	6	927	932	0 %	0 %	50 %	50 %	218533257
24	NC_011758	CGCGGT	2	12	997	1008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218533257
25	NC_011758	GCC	2	6	1019	1024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533257
26	NC_011758	GGCGCG	2	12	1100	1111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533257
27	NC_011758	CGGC	2	8	1134	1141	0 %	0 %	50 %	50 %	218533257
28	NC_011758	CGGG	2	8	1165	1172	0 %	0 %	75 %	25 %	218533257
29	NC_011758	TGC	2	6	1215	1220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533257
30	NC_011758	GAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218533257
31	NC_011758	GTC	2	6	1279	1284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533257
32	NC_011758	GCC	2	6	1346	1351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533257
33	NC_011758	TCG	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533257
34	NC_011758	GCGCT	2	10	1472	1481	0 %	20 %	40 %	40 %	218533257
35	NC_011758	GGC	2	6	1554	1559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533258
36	NC_011758	TGGCCT	2	12	1562	1573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533258
37	NC_011758	TCG	2	6	1579	1584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533258
38	NC_011758	CGG	2	6	1650	1655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533258
39	NC_011758	GCC	2	6	1705	1710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533258
40	NC_011758	CGTG	2	8	1724	1731	0 %	25 %	50 %	25 %	218533258
41	NC_011758	CGGCG	2	10	1785	1794	0 %	0 %	60 %	40 %	218533258
42	NC_011758	CAG	2	6	1805	1810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533258
43	NC_011758	GCC	2	6	1871	1876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533259
44	NC_011758	CCGG	2	8	1913	1920	0 %	0 %	50 %	50 %	218533259
45	NC_011758	GC	3	6	1927	1932	0 %	0 %	50 %	50 %	218533259
46	NC_011758	TGGC	2	8	1939	1946	0 %	25 %	50 %	25 %	218533259
47	NC_011758	CCG	2	6	1949	1954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533259
48	NC_011758	GC	3	6	1986	1991	0 %	0 %	50 %	50 %	218533259
49	NC_011758	CGT	2	6	2079	2084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533259
50	NC_011758	ACCGCC	2	12	2093	2104	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	218533259
51	NC_011758	GCC	2	6	2116	2121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533259
52	NC_011758	AGGA	2	8	2189	2196	50 %	0 %	50 %	0 %	218533259
53	NC_011758	ACG	2	6	2375	2380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533259
54	NC_011758	CGCC	2	8	2544	2551	0 %	0 %	25 %	75 %	218533259
55	NC_011758	GCC	2	6	2632	2637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533259
56	NC_011758	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218533259
57	NC_011758	ATTG	2	8	2679	2686	25 %	50 %	25 %	0 %	218533259
58	NC_011758	CGA	2	6	2691	2696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533259
59	NC_011758	GGT	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218533259
60	NC_011758	GCGA	2	8	2726	2733	25 %	0 %	50 %	25 %	218533259
61	NC_011758	GATC	2	8	2787	2794	25 %	25 %	25 %	25 %	218533259
62	NC_011758	TCGG	2	8	2795	2802	0 %	25 %	50 %	25 %	218533259
63	NC_011758	GGT	2	6	2814	2819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218533259
64	NC_011758	GAA	2	6	2827	2832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218533259
65	NC_011758	CGT	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533259
66	NC_011758	TCG	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533259
67	NC_011758	GCGG	2	8	2892	2899	0 %	0 %	75 %	25 %	218533259
68	NC_011758	CG	3	6	3046	3051	0 %	0 %	50 %	50 %	218533259
69	NC_011758	TGA	2	6	3054	3059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218533259
70	NC_011758	CGGC	2	8	3266	3273	0 %	0 %	50 %	50 %	218533260
71	NC_011758	CCG	2	6	3287	3292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533260
72	NC_011758	CGGC	2	8	3317	3324	0 %	0 %	50 %	50 %	218533260
73	NC_011758	GGC	2	6	3350	3355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533260
74	NC_011758	GC	3	6	3369	3374	0 %	0 %	50 %	50 %	218533260
75	NC_011758	GCC	2	6	3408	3413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533260
76	NC_011758	CGAC	2	8	3481	3488	25 %	0 %	25 %	50 %	218533260
77	NC_011758	GCC	2	6	3529	3534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533260
78	NC_011758	TCGGC	2	10	3572	3581	0 %	20 %	40 %	40 %	218533260
79	NC_011758	GCG	2	6	3583	3588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533260
80	NC_011758	CGC	2	6	3597	3602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533260
81	NC_011758	CGC	2	6	3618	3623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533260
82	NC_011758	CGGC	2	8	3635	3642	0 %	0 %	50 %	50 %	218533260
83	NC_011758	GAG	2	6	3713	3718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218533260
84	NC_011758	CCG	2	6	3752	3757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533260
85	NC_011758	CG	3	6	3796	3801	0 %	0 %	50 %	50 %	218533260
86	NC_011758	GCA	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533261
87	NC_011758	CG	3	6	4002	4007	0 %	0 %	50 %	50 %	218533261
88	NC_011758	ACG	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533261
89	NC_011758	GCG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533261
90	NC_011758	CGT	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533261
91	NC_011758	TCG	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533261
92	NC_011758	CGAT	2	8	4185	4192	25 %	25 %	25 %	25 %	218533261
93	NC_011758	GC	3	6	4233	4238	0 %	0 %	50 %	50 %	218533261
94	NC_011758	CTG	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533261
95	NC_011758	CG	4	8	4297	4304	0 %	0 %	50 %	50 %	218533261
96	NC_011758	CGA	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533261
97	NC_011758	TCC	2	6	4400	4405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218533261
98	NC_011758	CGAGG	2	10	4854	4863	20 %	0 %	60 %	20 %	218533262
99	NC_011758	GTG	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218533262
100	NC_011758	GCC	2	6	4932	4937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533262
101	NC_011758	GCG	2	6	4961	4966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533262
102	NC_011758	GCC	2	6	4968	4973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533262
103	NC_011758	CG	3	6	5013	5018	0 %	0 %	50 %	50 %	218533262
104	NC_011758	CTGG	2	8	5022	5029	0 %	25 %	50 %	25 %	218533262
105	NC_011758	GCCG	2	8	5103	5110	0 %	0 %	50 %	50 %	218533262
106	NC_011758	GGC	2	6	5121	5126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533262
107	NC_011758	GC	3	6	5136	5141	0 %	0 %	50 %	50 %	218533262
108	NC_011758	CG	3	6	5151	5156	0 %	0 %	50 %	50 %	218533262
109	NC_011758	GCCGT	2	10	5179	5188	0 %	20 %	40 %	40 %	218533262
110	NC_011758	CGC	2	6	5255	5260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533262
111	NC_011758	GCGCG	2	10	5270	5279	0 %	0 %	60 %	40 %	218533262
112	NC_011758	CCA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218533262
113	NC_011758	GTA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218533262
114	NC_011758	GAGC	2	8	5363	5370	25 %	0 %	50 %	25 %	218533262
115	NC_011758	CGG	3	9	5382	5390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533262
116	NC_011758	CGT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533262
117	NC_011758	GAT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218533262
118	NC_011758	GCG	2	6	5442	5447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533262
119	NC_011758	CGG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533262
120	NC_011758	TCG	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533262
121	NC_011758	CGT	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533262
122	NC_011758	GCA	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533262
123	NC_011758	CGA	2	6	5603	5608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533262
124	NC_011758	GCG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533262
125	NC_011758	CGC	2	6	5790	5795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533262
126	NC_011758	CCG	2	6	5815	5820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533262
127	NC_011758	AGG	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218533262
128	NC_011758	AGG	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218533262
129	NC_011758	CCGGCC	2	12	5939	5950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533262
130	NC_011758	GTG	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218533262
131	NC_011758	GC	3	6	6097	6102	0 %	0 %	50 %	50 %	218533262
132	NC_011758	AGG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218533262
133	NC_011758	GTC	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533262
134	NC_011758	CGA	2	6	6164	6169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533262
135	NC_011758	TCA	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218533262
136	NC_011758	GCCG	2	8	6630	6637	0 %	0 %	50 %	50 %	218533263
137	NC_011758	AAG	2	6	6655	6660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218533263
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139	NC_011758	CGA	2	6	6885	6890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533263
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162	NC_011758	GAG	2	6	7728	7733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218533264
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257	NC_011758	GCCG	2	8	11112	11119	0 %	0 %	50 %	50 %	218533268
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264	NC_011758	CAT	2	6	11499	11504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218533268
265	NC_011758	GC	4	8	11523	11530	0 %	0 %	50 %	50 %	218533268
266	NC_011758	AGCTC	2	10	11541	11550	20 %	20 %	20 %	40 %	218533268
267	NC_011758	GTC	2	6	11551	11556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533268
268	NC_011758	CGG	2	6	11559	11564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533268
269	NC_011758	CTC	2	6	11572	11577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218533268
270	NC_011758	CG	3	6	11605	11610	0 %	0 %	50 %	50 %	218533268
271	NC_011758	GGAA	2	8	11732	11739	50 %	0 %	50 %	0 %	218533268
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273	NC_011758	GCC	2	6	11802	11807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533268
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279	NC_011758	GGC	2	6	11940	11945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533268
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281	NC_011758	CCCT	2	8	12086	12093	0 %	25 %	0 %	75 %	218533269
282	NC_011758	GTG	2	6	12095	12100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218533269
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287	NC_011758	TCG	2	6	12215	12220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533269
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291	NC_011758	ACC	2	6	12416	12421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218533270
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299	NC_011758	CCG	2	6	12631	12636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533270
300	NC_011758	GCG	2	6	12669	12674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533270
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302	NC_011758	GTC	3	9	12730	12738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533270
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379	NC_011758	TCGGC	2	10	18907	18916	0 %	20 %	40 %	40 %	218533275
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383	NC_011758	CGT	2	6	19036	19041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533275
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385	NC_011758	CTCCA	2	10	19124	19133	20 %	20 %	0 %	60 %	218533275
386	NC_011758	CGT	2	6	19162	19167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533275
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389	NC_011758	CGAG	2	8	19185	19192	25 %	0 %	50 %	25 %	218533275
390	NC_011758	GC	3	6	19213	19218	0 %	0 %	50 %	50 %	218533275
391	NC_011758	ACT	2	6	19221	19226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218533275
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393	NC_011758	GCG	2	6	19413	19418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533275
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